因为母亲的事业，伊达不得不搬到另一个城镇，成为温特斯坦学校的“新女孩”她在新的班级里日子不好过：交不到朋友的的伊达不得已只能呆在羞涩内向的本尼旁边。一天，伊达的老师把孩子们介绍给莫蒂默·莫里森——一个周游世界寻找“神奇动物”的人。每一种动物都注定要成为孩子的灵魂伙伴。在所有人中，转校生伊达和本尼是班上最先拥有魔法伙伴的人！从现在起，本尼身边就有一只古老而聪明的海龟，而伊达有一只狡猾的狐狸。当物品在学校里不断消失，学校出现了超级小偷。孩子们和神奇的小动物为了帮助朋友洗刷嫌疑，解开超级小偷之谜。